Das várias preocupações que cercam os alimentos transgênicos, os efeitos sobre o meio ambiente são uma das principais. É aí que se encontram as maiores incertezas. Marafon, Claudio José. O Desencanto da Terra: Produção de alimentos, ambiente e sociedade. Rio de Janeiro: Garamond, 2011. (Adaptado) A avaliação do impacto ambiental de transgênicos no Brasil permanece com muitas questões a resolver, o que gera temores por parte de estudiosos e da sociedade civil, já que essa tecnologia também gera aspectos negativos ao setor produtivo como a: