A fragmentação de um hábitat aumenta drasticamente a sua quantidade de borda, sendo que o microambiente desse fragmento se torna diferenciado daquele encontrado no interior da floresta. Em relação a esses efeitos podemos afirmar: I. Ocorre aumento nos níveis de temperatura, luz, ventos e umidade na área de borda. II. Esse processo pode colocar em contato populações de animais silvestres e espécies domésticas, aumentando a possibilidade de disseminação de doenças. III. Ocorre uma descaracterização na vegetação original, com aumento de trepadeiras e outras espécies de crescimento rápido. IV. A fragmentação diminui a vulnerabilidade dos fragmentos à invasão de espécies exóticas e nativas ruderais.